يستخدم ميثيل ثلاثي فلورو الأسيتات ككاشف لتثليث فلورة الأمينات والأحماض الأمينية. يشكل ميثيل ثلاثي فلورو الأسيتات مع فلوريد السيزيوم أو كلوريد السيزيوم ويوديد النحاس كاشفًا قيمًا لتثليث فلورة اليوديدات والبروميدات العطرية (أو غير العطرية). تمت دراسة امتزاز ميثيل ثلاثي فلورو الأسيتات على السيليكا غير المتبلورة. كما تم تحليل آلية تفتت أيونات ميثيل ثلاثي فلورو الأسيتات غير المستقرة باستخدام مطيافية طاقة الحركة الأيونية وتحليلات المدار الجزيئي. يعتبر ميثيل ثلاثي فلورو الأسيتات سائلًا عديم اللون يستخدم ككاشف لتثليث فلورة اليوديدات والبروميدات العطرية أو غير العطرية، بالإضافة إلى استخدامه في تثليث فلورة الأمينات والأحماض الأمينية، مما يجعله مركبًا متعدد الاستخدامات في التفاعلات والعمليات الكيميائية المختلفة.