3-فلوروفينيل أيزوسيانات تم استخدامه في تخليق لينزوليد. كما تم استخدامه في تحضير 6-يوريدوبيورينات المستبدلة، 6(N2-3-فلوروفينيل)يوريدوبيورين. 3-فلوروفينيل أيزوسيانات هو لبنة بناء فلورية عطرية تستخدم في التخليق الكيميائي.