هيكساهيدرات ماغنسيوم بيركلورات هو مركب معدني بلوري أبيض شديد الامتصاص للرطوبة. يمكن تجفيفه لإنتاج ماغنسيوم بيركلورات اللامائي، المعروف بكفاءته كعامل حفاز كهربي في تفاعلات كيميائية متنوعة. يستخدم كعامل حفاز فعال في تخليق α-أمينوفوسفونات وإيمينات وفينيل هيدرازونات من تفاعل مركبات الكربونيل مع الأمينات وفينيل هيدرازين بانتاجية عالية في درجات حرارة الغرفة وأوقات تفاعل قصيرة. كما يستخدم في الصناعة الدوائية كعامل حفاز كهربي للاختزال غير الإنزيمي للدايهيدروبيريدينات المصنعة، ويمكن استخدامه في تكوين بطاريات أيون الماغنسيوم.