موليبدات الأمونيوم هو ملح أمونيوم يتكون من أيونات الأمونيوم والموليبدات بنسبة 2:1. وهو مسحوق عديم اللون أو أبيض أو مصفر قليلاً، ويستخدم ككاشف تحليلي للتحليل الكمي للفوسفات والسيليكات والزرنيخات والرصاص في محاليلها المائية. يُستخدم أيضًا في التلوين السلبي بالتبريد وكصبغة سلبية في المجهر الإلكتروني البيولوجي، وفي دراسة تبلور البروتينات الغشائية المعبر عنها خالية من الخلايا. يمكن تحضيره عن طريق إذابة ثالث أكسيد الموليبدينوم في الأمونيا.