5-(ثنائي فلورو ميثوكسي)-2-(((3،4-ثنائي ميثوكسي-2-بيريدينيل)ميثيل) سلفينيل)-1H-بنزيميدازول صوديوم، المعروف أيضًا باسم بانتوبرازول صوديوم، هو مسحوق بلوري أبيض إلى أبيض مائل للصفرة، قابل للذوبان بسهولة في الماء، قليل الذوبان جدًا في محلول الفوسفات عند درجة حموضة 7.4، وغير قابل للذوبان عمليًا في الهكسان. وهو مثبط لمضخة البروتون يحتوي على نيتروجين ضعيف القاعدية (بيريدين N، pKa 3.83) وبروتون بنزيميدازول (pKa 0.11)، مما يسهل صياغته كملح صوديوم. يعتمد استقرار المركب في المحلول المائي على درجة الحموضة، حيث تزداد سرعة التحلل مع انخفاض درجة الحموضة.