2-كلوروبيريميدين يخضع لتفاعل اقتران متقاطع محفز بالكوبالت مع هاليدات الأريل. وهو بيريميدين أحادي الكلور له نشاط تنظيم نمو النبات. يعتبر 2-كلوروبيريميدين كاشفًا مفيدًا في تحضير مضادات الفيروسات والمركبات النشطة بيولوجيًا الأخرى. تم استخدامه في تخليق صبغة الفلورسنت 4؟-(1،1؟-(5-(2-ميثوكسي فينوكسي)-[2،2؟-بايبيريميدين]-4،6-داييل)بيس(1H-بيرازول-3،1-داييل)) ديانيليلين، وحساس حيوي لاختبار البروتين، و2-أمينو-4-هيتروأريل بيريميدينات، ومشتقات أوكتاهيدروبيرولو[2،3]بيريدين. يتميز 2-كلوروبيريميدين بخصائصه الكيميائية كبلورات أو مسحوق بلوري أصفر إلى برتقالي باهت.