يساعد تفاعل مجموعات الكربوكسيل في تفتيت الأيونات الجزيئية لحمض سيس-سيكلوبوتان-1،2-ثنائي الكربوكسيل على تمييزه عن حمض ترانس-سيكلوبوتان-1،2-ثنائي الكربوكسيل. حمض ترانس-سيكلوبوتان-1،2-ثنائي الكربوكسيل هو مركب كيميائي يتميز بتركيبه الجزيئي الفريد، حيث توجد مجموعات الكربوكسيل في تكوين ترانز. هذا الترتيب المميز يميزه عن أيزومر السيس، حمض سيس-سيكلوبوتان-1،2-ثنائي الكربوكسيل، ويسمح بتطبيقات محددة في مختلف الصناعات.