سلفاميثوكسازول هو عامل مضاد للميكروبات فعال بشكل خاص في علاج المكورات العنقودية الذهبية والإشريكية القولونية. يستخدم بشكل رئيسي لعلاج كوليرا الدواجن. يمكن استخدامه كدواء مضاد للعدوى ولعلاج والوقاية من التهابات المسالك البولية الحادة والمزمنة، والتهابات الجهاز التنفسي، والتهابات الأمعاء، وعدوى السالمونيلا، والتهاب الأذن الوسطى الحاد عند الأطفال، والتهاب السحايا. مثل السلفيسوكسازول، هذا الدواء فعال في علاج الالتهابات التي تسببها العقديات، والمكورات البنية، والمكورات الرئوية، والمكورات العنقودية وكذلك عصيات القولون. يمنع هذا المضاد الحيوي السلفوناميدي تخليق حمض الديهيدروفوليك عن طريق تثبيط إنزيم ديهيدروبتيروات سينثيز.