أوميبرازول هو عامل قوي مضاد لإفراز المعدة مع تأثير مثبط انتقائي على مضخة البروتون H+,K+-ATPase. وهو فعال للغاية في علاج قرحة الاثني عشر ومتلازمة زولينجر-إيليسون، ويُذكر أنه متفوق على رانيتيدين في علاج التهاب المريء الارتجاعي. أوميبرازول هو مثبط لمضخة البروتون يستخدم لعلاج أمراض مثل مرض الارتجاع المعدي المريئي (GERD)، ويستخدم لقرحة المعدة والاثني عشر، والتهاب المريء الارتجاعي أو التآكلي، ومتلازمة زولينجر-إيليسون. كما أنه فعال لقرحة المعدة والاثني عشر التي لا تستجيب لمضادات مستقبلات H2.