فيدارابين هو نظير ستيريوكيميائي للأدينوزين. هذا النظير لنوكليوزيد البيورين يظهر نشاطًا انتقائيًا ضد فيروس الهربس. يتم استبدال بقايا الريبوز ببقايا أرابينوز. مثل الأسيكلوفير، يتحول إلى أحادي- وثنائي- وثلاثي الفوسفات في الخلايا المصابة بالفيروس، مما يثبط بوليميراز الحمض النووي، وبالتالي يمنع تخليق الحمض النووي للفيروس بما يقارب 20-40 مرة أكثر من الخلايا المضيفة. يتم استقلابه بسهولة إلى مركب أقل نشاطًا ولكنه لا يزال مضادًا للفيروسات - أرابينوزيلهيبوكزانثين.