أنهيدريد الهيبتافلوروبوتيريك هو عامل مشتق لكروماتوغرافيا الغاز (GC) يُستخدم لإعداد مشتقات متطايرة للأحماض الأمينية والمركبات النشطة بيولوجيًا الأخرى. يُستخدم بشكل متكرر كعامل أسيل لتشكيل مشتقات الأمينات الأولية والثانوية. قد يعطي أنهيدريد الهيبتافلوروبوتيريك المتاح تجاريًا عوائد منخفضة من المشتقات بسبب وجود حمض الهيبتافلوروبوتيريك. يُستخدم لزيادة تطاير العينة وإدخال ذرات الفلور لتحسين حدود الكشف في تطبيقات كروماتوغرافيا الغاز. كما يُستخدم ككاشف مشتق لتحليل محتوى المتماكب الفراغي للببتيدات الاصطناعية بواسطة كروماتوغرافيا الغاز - مطياف الكتلة. وهو كاشف أسيل بيرفلورو يشكل مشتقات متطايرة مستقرة مع الكحولات والأمينات والفينولات، ويُستخدم بشكل رئيسي لإعداد مشتقات كهرومغناطيسية للكشف عن الالتقاط الإلكتروني.