ماغاينين الثاني هو عضو في عائلة الببتيدات المضادة للميكروبات. وهو ببتيد موجب الشحنة بتسلسل أحماض أمينية Gly-Ile-Gly-Lys-Phe-Leu-His-Ser-Ala-Lys-Lys-Phe-Gly-Lys-Ala-Phe-Val-Gly-Glu-Ile-Met-Asn-Ser. يتميز ماغاينين الثاني بكونه قابل للذوبان في الماء وغير مسبب لانحلال الدم عند تركيزاته الفعالة والمضادة للميكروبات. وهو جزء من عائلة الببتيدات المضادة للميكروبات، ويتميز بطبيعته الموجبة الشحنة وتسلسله الفريد للأحماض الأمينية. كما أنه قابل للذوبان في الماء وغير مسبب لانحلال الدم عند التركيزات الفعالة، ويمتلك خصائص مذبذبة تساهم في نشاطه المضاد للميكروبات.