ثلاثي فلورو (ميثانول) البورون هو كاشف يستخدم في تحليل GC لحمض الريتالينيك. يعمل كبديل لـ Cl2CHCO2H في تخليق قليل القواعد الغنية بالبيورين. يستخدم كحمض لويس في تحضير ثنائي البيروكسيدات الجيمينالية من الكيتالات وإينول الإيثرات مع بيروكسيد الهيدروجين t-بوتيل. كما يستخدم ككاشف لإزالة الأسيتيل الخفيفة للأمينات. تم استخدامه في نقل الميثيل لـ 1،2-ثنائي أسيل الجلسرول (DAG) الذي تم تنقيته باستخدام HPLC. يمكن استخدامه لمعالجة الدهون أثناء تحليل GC لتحديد إسترات ميثيل الأحماض الدهنية وثنائي ميثيل الأسيتالات. يعتبر ثلاثي فلورو (ميثانول) البورون (BF-M) كاشفًا للإسترة وهو محفز حمضي قوي لإسترة الأحماض الدهنية. يقوم بسهولة بتحطيم الأصباغ الأسيتيلية مما يؤدي إلى مجموعات أمينية حرة. يحفز BF-M إسترة الزيوت النباتية لتكوين الديزل الحيوي.