أبروتينين هو مثبط رئيسي للتربسين. يستخدم كمثبط للبروتياز في المقايسات المناعية الإشعاعية للهرمونات متعددة الببتيد. وهو مثبط عكسي لسيرين البروتيازات مثل التربسين (Ki = 0.06 pM)، الكيموتريبسين (Ki = 9.5 nM)، والكاليكرين (Ki = 0.8 nM). وهو مثبط أضعف للثرومبين (Ki = 0.1-0.8 mM) والتربسينوجين (Ki = 2 ميكرومولار). كما يثبط أبروتينين بشكل تنافسي إنزيمات nNOS وiNOS بقيم Ki تبلغ 50 و78 ميكرومولار على التوالي. يستخدم على نطاق واسع كأداة لتنقية البروتين لمنع تحلل البروتينات محل الاهتمام بواسطة البروتيازات الموجودة في عينات الأنسجة.