ميثيل فينيل سلفوكسيد هو وسيط دوائي مهم. يستخدم في تصنيع: 1،3-ديثيان الموسوم نظائريًا (مركب وسيط مفيد)، وللفينافير (مثبط قوي لإنزيم بروتياز فيروس نقص المناعة البشرية)، والسلفوكسيمينات، وفي دراسات حول التوزيع بين المذيب والماء.