5-كلورو-1،3-ثنائي ميثوكسي البنزين هو وسيط اصطناعي مفيد في التخليق الصيدلاني. تم استخدامه في التخليق الانتقائي للمنطقة لمركب TMC-264، وهو هيكل ثلاثي الحلقات يحتوي على هيكل كلورو-1H-ثنائي البنزوبايران-4،6-ديون. يشارك 5-كلورو-1،3-ثنائي ميثوكسي البنزين في تفاعلات اقتران سوزوكي-مياورا لكلوريدات الأريل وهيتيروأريل مع بورات ثلاثي فلورو السيكلوبوتيل البوتاسيوم. وهو مركب عضوي يتميز بوجود مجموعة كلورو ومجموعتين ميثوكسي متصلتين بحلقة البنزين.