يستخدم البيناكول في تحضير وسائط اصطناعية مثل بيناكولبوران، بيس(بيناكولاتو)ديبورون وبيناكولكلوروبوران عن طريق التفاعل مع ثلاثي كلوريد البورون. بالإضافة إلى ذلك، يلعب دورًا مهمًا كوسيط لمركبات نشطة بيولوجيًا مثل مضادات الفيروسات، مضادات البكتيريا، مضادات الفطريات ومضادات السل. تم دراسة تفاعل اقتران البيناكول مع الإلكترايد غير العضوي [Ca2N](+)·e(-) كمتبرع بالإلكترون في المذيبات العضوية. يستخدم البيناكول كوسائط عضوية.