يستخدم كلوريد المنغنيز رباعي الهيدرات في الصباغة (بِستر المنغنيز)، والتطهير، وتنقية الغاز الطبيعي، وكمجفف لزيت بذر الكتان، وفي البطاريات الكهربائية. وهو كاشف كيميائي غير عضوي يُستخدم في دراسات الأكسدة والتفاعلات. يعتبر كلوريد المنغنيز رباعي الهيدرات عاملًا مفيدًا للكشف عن الحويصلات الفوسفوليبيدية. وهو كلوريد فلزي مائي. تم تقييم سميته في الفئران السويسرية. يشارك في تحضير معقدات فلزية (II) من روابط مختلطة مثل ثنائي ميثيل ثيوكارباميك وحمض البارا-أمينوبنزويك. يُعرف أيضًا باسم كلوريد المنغنيز (II) رباعي الهيدرات، وهو مركب بلوري غير عضوي.