كاربوكسي ببتيداز بي هو إنزيم يعمل على قطع بقايا اللايسين والأرجينين من الطرف الكربوكسيلي للبروتينات والببتيدات. وهو إنزيم يعتمد على الزنك ويؤدي دورًا حاسمًا في معالجة وتنظيم هرمونات الببتيد والجزيئات النشطة بيولوجيًا الأخرى. يستخدم في الصناعة الدوائية كأداة بحثية لتطوير مقايسات الفلورة المتجانسة المقاسة بالزمن (HTRF) لقياس نشاط الإنزيم في صيغة فحص عالي الإنتاجية مصغر. كما يستخدم في الأبحاث الطبية الحيوية كمرجع لقياس نشاط كاربوكسي ببتيداز في حبيبات الغدة النخامية المكسورة المشتقة من الفص الأمامي والوسطى للفئران، ولتحضير عينات البلازما بإزالة الأحماض الأمينية الأساسية من الطرف الكربوكسيلي للحصول على شريط متميز لكل نمط فردي أثناء الرحلان الكهربائي لـ C4.