يحفز التحلل المائي لمجموعات أحادية الفوسفات الطرفية 5' من الحمض النووي DNA والـRNA. يمنع التصاق شظايا الأحماض النووية ببعضها. يستهدف الأحماض النووية الطرفية 5' للتحقيقات الجزيئية. يُستخدم فوسفاتاز القلوي عادةً لإزالة الفوسفات الطرفي 5' من الأحماض النووية. فوسفاتاز القلوي من أمعاء العجل، درجة نقاء EIA يُستخدم لنزع الفوسفات من ناقلات الاستنساخ لمنع إعادة تدويرها أثناء عملية الربط، ونزع الفوسفات من الحمض النووي قبل وضع العلامات الطرفية باستخدام كيناز متعدد النيوكليوتيد T4، ومعالجة dNTPs في تفاعلات PCR قبل التتابع أو تحليل تعدد الأشكال النوكليوتيدية المفردة، ونزع الفوسفات من الحمض النووي DNA والـRNA. كما يُستخدم لإزالة الفوسفات الطرفي 5' من الأحماض النووية أثناء تفاعلات الاستنساخ الجزيئي. فوسفاتاز القلوي من الغشاء المخاطي لأمعاء البقر يعمل كفوسفومونوإستراز وبيروفوسفاتاز. EC 3.1.3.1، المعروف أيضًا باسم فوسفاتاز القلوي، هو إنزيم يحفز التحلل المائي لمجموعات أحادية الفوسفات الطرفية 5' من الحمض النووي DNA والـRNA. يلعب دورًا حاسمًا في منع التصاق شظايا الأحماض النووية ببعضها ويُستخدم على نطاق واسع في تطبيقات البيولوجيا الجزيئية المختلفة.