أنهيدريد البيرفلوروبروبيونيك هو سائل عديم اللون يستخدم كعامل مشتق في التطبيقات الكيميائية والتحليلية. يستخدم في تحليل المحتوى المتماكب للببتيدات الاصطناعية بواسطة كروماتوغرافيا الغاز-مطياف الكتلة (GC-MS)، وكذلك في كشف السينفرين في المكملات الغذائية. يعمل كعامل مشتق للأمينات والكحولات، ويستخدم في تحضير مشتقات الهالوجين من الأحماض الفينولية لتحديد الأحماض الحيوية في السائل النخاعي. كما يستخدم في كشف الأمينات الذاتية مثل 1،2،3،4-تتراهيدروإيزوكينولين في أدمغة الفئران، وفي تحديد مستقلبات الدوبامين في المخطط بواسطة كروماتوغرافيا الغاز-السائل.