بنتافلورو-1-بروبانول هو كاشف مفيد لتحضير إيثرات/بنزوات (أوكسويندولينيل) عبر تفاعلات وظيفية ضوئية O-H للأميدات الحلقية الديازو. يستخدم هذا المركب ككاشف اشتقاقي في كشف التربتوفان-L والكينورينين-L والسيروتونين وحمض الكينولينيك المسمى وغير المسمى بـ 15N2 في بلازما الإنسان والجرذان بواسطة GC-MS. كما يستخدم في التحليل المتزامن للكوكايين والكوكاييثيلين ومنتجاتهم الأيضية والتحللية الحرارية في الدم والبول والعضلات. بالإضافة إلى ذلك، يستخدم في تحضير ثلاثي فلورو ميثيل ينامينات التي تحول الألدهيدات إلى أميدات ثلاثي فلورو ميثيل-α،β-غير مشبعة، ولتوليد إيثرات α-كيتو المفلورة مع الألكينات. يعتبر بنتافلورو-1-بروبانول أيضًا عامل تنظيف بديل للكلوروفلوروكربونات.