اليوبيكويتين هو بروتين كروي يتكون من 76 حمضًا أمينيًا ويحتوي على بقايا ليسين على سطحه. وزنه الجزيئي هو 8565 دالتون. يمكن لليوبيكويتين الموسوم بعلامة FLAG الطرفية N أن يحل محل اليوبيكويتين في تكوين مترافقات بروتين متعدد اليوبيكويتين. تتيح علامة FLAG فصل وإثراء مترافقات البروتين على أعمدة تقارب مضاد FLAG وكشف المترافقات في لطخة ويسترن باستخدام أجسام مضادة لـ FLAG.