تُستخدم صبغة جيمزا في تلوين الخلايا والأفلام الدموية. تشير صبغة جيمزا المعدلة إلى تغيير درجة الحموضة من 6.8 المعتادة إلى 9.0. تعمل الصبغة ككاشف مختبري وملون للمجهر، وتُستخدم لاكتشاف الملاريا وطفيليات أخرى مثل اللولبيات والطلائعيات. كما تُستخدم في التلوين التفريقي بين الخلايا البكتيرية والبشرية، ويمكن دمجها مع صبغات أخرى مثل ماي-غرونوالد أو رايت.