ينتمي إنزيم بروتوكاتيكوات 3،4-ديوكسيجينيز إلى عائلة الإنزيمات غير الهيمية المحتوية على الحديد. يحتوي الموقع النشط للإنزيم على أيون الحديديك (Fe3+). يستخدم الإنزيم في أنظمة إزالة الأكسجين مع بروتوكاتيكوات (PCA) وتولوكس. يعمل مركز الحديد غير الهيمي في الإنزيم على تحفيز تحويل PCA والأكسجين الجزيئي إلى حمض β-كاربوكسي-سيس،سيس-موكونيك، بينما يعمل مضاد الأكسدة تولوكس على تقليل الوميض البطيء والتبييض الضوئي لأصباغ السيانين. يستخدم الإنزيم في تحضير محلول التصوير مع DMB-BSA (مخزن حركية الداينين-ألبومين مصل البقر)، ATP وبروتوكاتيكوات في اختبار حركية الجزيء الواحد. يلعب EC 1.13.11.3 دورًا حاسمًا في تحلل المركبات العطرية.